Disputas: Dhurba Adhikari

Tittel på avhandlingen:

Evolutionary genomics of pelvic spine reduction in Gasterosteus aculeatus

Tittel på prøveforelesning:

Connecting micro and macro-evolutionary processes - insights from limb development

Bedømmelseskomité:

• Førsteamanuensis Felicity C. Jones, Groningen Institute of Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Nederland
• Forsker Andrew David Foote, Senter for økologisk og evolusjonær syntese, Universitetet i Oslo
• Professor Leslie R. Noble, Fakultet for biovitenskap og akvakultur, Nord universitet

Veiledere:

• Hovedveileder: Professor Jarle Tryti Nordeide, Fakultet for biovitenskap og akvakultur, Nord universitet
• Medveileder: Professor Steinar Daae Johansen, Fakultet for biovitenskap og akvakultur, Nord universitet
• Medveileder: Professor Emeritus Truls Borg Moum, Fakultet for biovitenskap og akvakultur, Nord universitet

Sammendrag av avhandlingen​:

Marine trepigga stingsild har kolonisert og tilpassa seg ferskvatn. Stingsild i ferskvatn reduserer ofte tal på side-plater og side-piggane kan bli tilbakedanna. Tidlegare studie viser at tilbakedanna piggar hjå nord-amerikanske stingsild skyldast variasjon på dei regulerande gena PelA og PelB som kontrollerer uttrykket av Pitx1. I Froskelandsvassdraget i Nordland har det øvre vatnet ei blanding av stingsild med normale, asymmetriske, og utan sidepiggar. Alle stingsild i nabovatnet nedanfor og i sjøen har normale piggar. Dette studiet undersøker årsaker til mangel på normale sidepiggar i Froskelandsvassdraget.

PelA og PelB vart sekvensert med Sanger-teknologi, og mitokondrie og nukleært genom med  neste-generasjons-sekvensering. Sekvensane på PelA og PelB til stingsilda varierte blant fisk innan og mellom dei tre lokalitetane, men ingen samanheng vart påvist mellom dei to kontrollområda og utvikling av sidepiggar. To ulike grupper mitokondrie-genom vart identifisert i den øvre innsjøen, mens berre eitt av dei i vart funne i nabovatnet. Både mitogenoma og dei nukleære genoma varierte mest mellom marine stingsild. Dei nukleære genoma til fisk frå dei to ferskvatna var meir ulike enn mellom vatna og sjøen.   

Kva del av genomet som bestemmer tilbakedanning av sidepiggar til stingsild i det øvre vatnet vart ikkje identifisert. Truleg er andre deler av genomet enn PelA og PelB involvert, og eit området på kromosom 9 er identifisert som lovande.